南海冷泉蛇尾线粒体基因组分析

作者:sio
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  自然资源部海洋生态系统动力学实验室(MED)深海生物研究团队在海洋学期刊《Deep Sea Research Part I》发表了题为“Description of a new species of Histampica (Ophiuroidea: Ophiothamnidae) from cold seeps in the South China Sea and analysis of its mitochondrial genome”的研究论文。该研究报导了在南海冷泉发现的组蛇尾新种,并对其线粒体全基因组进行了分析。

  蛇尾是一种分布广泛的海洋底栖生物,但在热液和冷泉等化能合成生境中报道的种类很少。本研究描述了采自南海海马冷泉和蛟龙(又称F站)冷泉组蛇尾属(Histampica)物种,并基于形态和遗传分析的方法判定其为新种,命名为“海马组蛇尾(Histampica haimaensis sp.nov)”。这是在化能合成生境中首次报道的组蛇尾物种,具有很高的丰度。

图1 海马组蛇尾(Histampica haimaensis)外部形态

图2 海马组蛇尾(H. haimaensis)线粒体基因组圈图

  对该蛇尾的线粒体基因分析发现,两个种群之间COX1基因差异很小,种群之间没有生物地理结构。 该蛇尾具有特殊的线粒体基因排列,系统发育历史上经历了5次基因重排,具有6个正向选择位点分布于4个基因(COX2, ND1, ND2, ND5)上,这些可能是对特殊化能合成生境适应的结果。

  本研究得到国家自然科学基金(42076135),国家重点研究发展计划(2017YFC0306701)等课题的共同资助。


引用:

Qihang Li, Yixuan Li, Jieying Na, Xiqiu Han, Gordon L.J. Paterson, Kun Liu, Jian-Wen Qiu*, Dongsheng Zhang*, 2021. Description of a new species of Histampica (Ophiuroidea: Ophiothamnidae) from cold seeps in the South China Sea and analysis of its mitochondrial genome. Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers,  https://doi.org/10.1016/j.dsr.2021.103658